Nova faza pandemije: opasan soj "Delta"

2024 Autor: Seth Attwood | [email protected]. Zadnja izmjena: 2023-12-16 15:59

Novi indijski soj covid-19, koji su naučnici već nazvali "Delta", izazvao je treći talas pandemije u mnogim zemljama. U samom Nju Delhiju situacija je jednostavno katastrofalna - 30.000 slučajeva dnevno. Instituti su počeli da proučavaju "Deltu" i odmah oglasili alarm.

Pokazalo se da je novi soj ne samo infektivniji, već i manje osjetljiv na antitijela. To znači da se može uspješno oduprijeti "kontranapadima" koje će naš imuni sistem voditi protiv njega.

Kada se varijanta koronavirusa, sada nazvana "Delta", prvi put pojavila u indijskoj državi Maharaštra u decembru 2020., nije izgledalo ništa posebno. Ali kada je nekoliko mjeseci kasnije pogodio New Delhi, posljedice su bile najrazornije, sa skoro 30.000 slučajeva svakog dana krajem aprila. “Odjednom je počeo da dominira i potpuno je uništio soj Alpha, koji je do tada bio najrašireniji u gradu”, kaže Anurag Agrawal, šef Instituta za genom i integrativnu biologiju u New Delhiju.

Čini se da je malo vjerovatno da će se New Delhi suočiti s još jednom velikom epidemijom, rekao je Agrawal, jer su mnogi njegovi stanovnici ili bolesni ili vakcinisani. Ali pokazalo se da su ova sredstva odbrane od Delte nemoćna. Zarazniji je i bježi od imunološkog sistema, kaže: "Zid od tri metra oko grada kao da se pretvorio u zid od pola metra, preko kojeg nije teško preći."

Iz New Delhija, soj se brzo proširio i sada se čini da zapljuskuje svijet novim, razornim valom. U Velikoj Britaniji, Delta već čini više od 90% novih slučajeva: to je dovelo do ponovnog skoka broja slučajeva koronavirusa nakon oštrog pada, a prošle sedmice je vlada čak morala odgoditi završnu fazu svog plana otvaranja granica. Izbijanje Delte u Lisabonu primoralo je portugalsku vladu da uvede trodnevnu zabranu putovanja između glavnog grada i ostatka zemlje.

Ova opcija će do kraja avgusta činiti do 90 odsto svih slučajeva korona virusa u Evropskoj uniji, upozorila je danas čelnica Evropskog centra za prevenciju i kontrolu bolesti Andrea Amon. "Veoma je vjerovatno da će se Delta soj široko proširiti tokom ljeta, posebno među mladim ljudima koji nisu dio programa vakcinacije", rekla je ona. "Ovo bi ugroženije građane moglo izložiti riziku da se ozbiljno razbole ili čak umru. ako nisu u potpunosti vakcinisani."

Delta trke su zabilježene u Rusiji, Indoneziji i mnogim drugim zemljama. U SAD-u, gdje se procjenjuje da je prevalencija ovog soja najmanje 14%, CDC je 15. juna rekao da je to "od najveće zabrinutosti".

Uspon je izazvao niz studija kako bi se razumjelo zašto se Delta širi mnogo brže od ostale tri zabrinjavajuće varijante, ako je inače opasnija, i kako njen jedinstveni skup mutacija koje uzrokuju promjene u proteinskom okruženju može uzrokovati ozbiljnu štetu. Dolazak Delte je naglasio da se virus SARS-CoV-2 može prilagoditi i evoluirati u narednim mjesecima i godinama.

U ovom trenutku Delta predstavlja posebnu prijetnju najsiromašnijim zemljama, čiji je pristup vakcinama ograničen ili potpuno odsutan, kaže Sumya Shwaminathan, glavni naučni savjetnik Svjetske zdravstvene organizacije. „Ono što me najviše brine je šta će se dogoditi kada Delta stigne u Afriku“, kaže ona.

Studija javnog zdravstva Engleske istakla je potencijal proliferacije Delte. U poređenju sa Alfom, koja je lansirana u Velikoj Britaniji 2020., „imamo 50% ili 100% više prenosa“, kaže Adam Kucharski, programer modela na Londonskoj školi higijene i tropske medicine.

Ali Kuharsky također kaže da je smanjenje zaštite od vakcina moglo utjecati. Pfizer-BioNTech i AstraZeneca vakcine pružaju nešto manju zaštitu od simptomatskih infekcija sa novom varijantom nego za Alpha soj, na osnovu podataka iz Engleske i Škotske. Ljudi sa samo jednim udarcem su posebno ranjivi - kao i mnogi u Velikoj Britaniji. (Dvije doze bilo koje vakcine će i dalje pružiti isti visok nivo zaštite od hospitalizacije, čak i protiv Delte.) Nejasno je koliko dobro štite druge vakcine koje se koriste širom svijeta, a malo je dokaza o zaštiti kod onih koji su se oporavili od prošlih talasa koronavirusa.

Oba ova efekta - povećani prijenos i izbjegavanje imuniteta - teško je odvojiti jedan od drugog, ali šef Wellcome Trust-a, Jeremy Farrar, vjeruje da iza Delta skoka stoji prijenos, a ne zaobilaženje imuniteta. "Ako je Alpha oko 50% prenosiva od prirodnog soja, a Delta još 50%, onda govorimo o virusu koji je dvostruko prenosiviji od originalnog soja", objašnjava evolucijski virolog sa Univerziteta Oxford Aris Katzourakis.

To će značiti da bi se zemlje i populacije s niskom stopom vakcinacije mogle suočiti s velikim novim epidemijama. „Ako je brže širenje u potpunosti posljedica virusa, onda je ovo katastrofalna vijest za ostatak svijeta“, kaže Kuharski.

Povrh svega, Delta će verovatnije slati nevakcinisane građane u bolnicu nego Alfa. Rani podaci iz Velike Britanije sugeriraju da bi rizik od hospitalizacije mogao biti dvostruko veći. Sve zajedno, ove karakteristike bi mogle izazvati velike probleme u Africi, rekao je Schwaminathan. “Neće biti kiseonika, neće biti dovoljno bolničkih kreveta. A već znamo da su bolnički ishodi u Africi lošiji nego u drugim zemljama, kaže ona. "Dakle, to zaista može dovesti do veće stope smrtnosti čak i među mladim ljudima."

Mutacije ometaju antitijela

Naučnici su tek počeli da otkrivaju zašto je Delta toliko opasna. Fokusirali su se na skup od devet mutacija u genu koji kodira šiljasti protein koji ispituje površinu i omogućava virusu da uđe u ljudske ćelije. Jedna važna mutacija, nazvana P681R, mijenja aminokiselinu odmah pored mjesta cijepanja furina gdje ljudski enzim cijepa protein - ključni korak koji omogućava virusu da uđe u ljudske ćelije.

U soju Alpha, ova mutacija je učinila cijepanje efikasnijim. Prema jednoj preliminarnoj publikaciji krajem maja, Delta mutacije dodatno olakšavaju razgradnju furina. Istraživači nagađaju da bi to također moglo povećati prenosivost virusa.

Međutim, japanski istraživači koji su stvorili pseudoviruse koji nose istu mutaciju nisu potvrdili povećanu infektivnost u laboratorijskim uvjetima, a u Indiji su se druge varijante koronavirusa s istom mutacijom pokazale mnogo manje zaraznim od Delte, kaže evolucijski virolog sa Univerziteta. iz Edinburga, Andrew Rambaut). "Dakle, mora postojati interakcija sa nečim drugim u genomu."

Druge Delta mutacije mogu pomoći u potkopavanju imuniteta. Neki od njih mijenjaju N-terminalni domen kralježnice (NTD) koji strši iz površine proteina. U nedavnom članku u časopisu Cell, otkriveno je da jedna od NTD tačaka, nazvana "super-site", uvijek cilja na "super-potentna" neutralizirajuća antitijela iz oporavljenih pacijenata. Jedinstvene Delta mutacije uklanjaju aminokiseline na pozicijama 156 i 157 "superfrekvencije" i mijenjaju aminokiselinu 158 iz arginina u glicin - potonji eliminirajući direktnu kontaktnu tačku za vezivanje antitijela, objašnjava strukturni biolog sa Univerziteta Florida David Ostrov.

"Vjerujemo da je mutacija 157/158 jedna od karakterističnih Delta mutacija koje su dale soju ovaj fenotip izbjegavanja imuniteta", slaže se Trevor Bedford, kompjuterski biolog u Centru za istraživanje raka Fred Hutchinson.

Još jedna mutacija u super-regiji NTD takođe može da se bori protiv antitela. Naučnici bi trebali početi proučavati ulogu promjena u drugim delta proteinima, kaže Nevan Krogan, molekularni biolog sa Univerziteta Kalifornije u San Francisku. “Postoji mnogo toga što ne znamo o ovim opcijama na svakom nivou. Čini se da lutamo u mraku." Na primjer, "Delta" ima nekoliko mutacija u nukleokapsidnom proteinu, koji obavlja mnoge funkcije "poput švicarskog noža", objašnjava virolog David Bauer sa Instituta Francis Crick. Međutim, bit će potrebni mjeseci za eksperimentiranje kako bi se razjasnilo.

Ubrzana vakcinacija

U međuvremenu, naučnici se slažu: potrebna je hitna akcija da se zaustavi širenje nove varijante. „Zabrinutost Delte treba da nas motiviše da zaista ubrzamo vakcinaciju i povećamo dostupnost vakcine na polju gde Delta postaje sve popularnija“, rekla je virolog Angela Rasmusen sa Univerziteta u Saskačevanu. Američki predsjednik Joe Biden pozvao je Amerikance da dobiju potpunu vakcinaciju kako bi se zaštitili od Delte. Amon je danas pozvao evropske zemlje da ubrzaju planove za potpunu vakcinaciju ugroženog stanovništva.

Osim toga, rekla je, potrebno je zadržati ograničenja kako se nova opcija ne bi proširila i izazvala novi porast morbiditeta, hospitalizacija i smrti. Zemlje s ograničenim pristupom vakcinama moraju se vratiti mjerama kao što su fizičko distanciranje i maske, rekao je Rasmussen. A u Evropi, Amon je pozvao zemlje da učine i jedno i drugo: zadrže ograničenja dok rade na potpunom vakcinisanju ugroženog stanovništva.

Cilj nije samo spasiti živote, već spriječiti daljnji razvoj virusa. Širenje Delte pokazalo je da naučnici nisu u stanju prepoznati opasne nove varijante na vrijeme kako bi zaustavili njihovo širenje, kaže Emma Hodcroft, virolog sa Univerziteta u Bazelu, uprkos neviđenim globalnim naporima da se njihova evolucija prati u realnom vremenu. Bilo bi opasno pretpostaviti da će se SARS-CoV-2 tu zaustaviti, rekao je Katsurakis. “Sve u evoluciji što se dogodilo barem dvaput je već obrazac”, kaže on. "Ne bih se iznenadio da vidimo slične promjene u narednih godinu ili dvije."